Цитата: Заплатил только за июнь 3500 руб. За июль не заплатил, так как знал что будет перерасчет. А за август мы не начисляли. Уменьшили начисление июня и июля, т.е. июль сняли полностью (было начисленно 2000 руб.), июнь - из 3500 руб. сняли 500 руб. Получается правильное начисление июня 3000 руб., а оплата была 3500 руб. Но данная переплата образовалась только в августе на основании справки-перерасчета.
Вы не указали, когда именно заплатили за июль.
Но будем считать, что раньше, чем 1 августа.
Следовательно, на момент перерасчета было оплачено 3500 р.
После перерасчета получается, что начислено 3000 руб., а оплачено 3500 руб.
Следовательно, 500 руб. оплачены излишне. А поскольку вы эти 500 рублей не возвращаете, а засчитываете в счет следующих платежей, значит с них нужно начислить НДС, как с авансов (предоплат).
Успехов!